انواع مختلفی از دستگاه‌های میکرو سانتریفیوژ وجود دارند. نوع میکرو سانتریفیوژ بسته به اندازه و ظرفیت نمونه‌ای که می‌توانند در خود نگه دارند، متفاوت است. بنابراین، انتخاب یک میکروفیوژ مناسب در ارائه نتایج دقیق در مطالعات پزشکی بسیار حائز اهمیت است.
انواع مختلفی از دستگاه‌های میکرو سانتریفیوژ وجود دارند. نوع میکرو سانتریفیوژ بسته به اندازه و ظرفیت نمونه‌ای که می‌توانند در خود نگه دارند، متفاوت است. بنابراین، انتخاب یک میکروفیوژ مناسب در ارائه نتایج دقیق در مطالعات پزشکی بسیار حائز اهمیت است. اگرچه لوله‌های پلاستیکی (پلی‌پروپیلن) معمولاً ارزان‌تر هستند، اما در بسیاری از صنایع مختلف و آزمایشگاه‌های پزشکی از لوله‌های شیشه‌ای برای ذخیره نمونه استفاده می‌شود. در اینجا چند نمونه از رایج‌ترین و مهم‌ترین انواع میکرو سانتریفیوژ را آورده‌ایم:
1. سانتریفیوژ آماده‌سازی (Preparative centrifuge)
سانتریفیوژ آماده‌سازی نوعی میکروفیوژ سرعت بالا است که برای جداسازی ذرات کوچک میکروسکوپی یا همان اندامک‌های یک ماده استفاده می‌شود. این ذرات کوچک معمولاً شامل ویروس‌ها، پروتئین‌ها، کمپلکس‌های پروتئینی، لیپوپروتئین‌ها، RNA و پلاسمید DNA هستند.
2. سانتریفیوژ تحلیلی (Analytical centrifuge)
سانتریفیوژ تحلیلی به انواعی از سانتریفیوژها گفته می‌شود که در فرایندهای تحلیلی مورد استفاده قرار می‌گیرند. آن‌ها برای به دست آوردن اطلاعات کافی در مورد انواع مولکول‌ها در یک نمونه خاص با دانستن شکل کلی، شکل ساختاری و استوکیومتری زیر واحدها استفاده می‌شوند. سانتریفیوژهای تحلیلی همچنین در تعیین میزان رسوب ذرات کاربرد دارند.
سانتریفیوژ تحلیلی (Analytical centrifuge)
3. سانتریفیوژ زاویه ثابت (Angle fixed centrifuge)
این نوع سانتریفیوژ به شما اجازه می‌دهد که زاویه روتور را تنظیم کنید؛ تا امکان جداسازی صحیح اجزای نمونه فراهم شود. به عبارت دیگر، این میکروفیوژ روتور و لوله‌ها را در یک زاویه ثابت (معمولاً ۴۵ درجه) نگه می‌دارد. به این ترتیب، در طول فرایند سانتریفیوژ مشاهده می‌کنید که متراکم‌ترین ذرات نمونه به سمت زاویه نیروی گریز از مرکز جدا می‌شوند. در بسیاری از آزمایشات، ذرات متراکم، یک گلوله متمرکز در انتهای لوله تشکیل می‌دهند.
4. سانتریفیوژ سر چرخشی (Swing head centrifuge)
سانتریفیوژهای سر چرخشی از روتورهای چرخشی خود برای شکستن صحیح ماده در حین مرتب کردن فرایند جداسازی استفاده می‌کند.
5. سانتریفیوژ هماتوکریت (Hematocrit centrifuge)
سانتریفیوژ هماتوکریت با سرعت چرخش بین 7000 تا 15000 دور در دقیقه، از یک سیستم خاص برای تعیین کسر حجمی گلبول‌های قرمز خون و جداسازی ریز حجم‌های خون و محلول‌ها استفاده می‌کند. آن‌ها می‌توانند مقادیر هماتوکریت (HCT) را برای آزمایشات ژنتیک، ایمنی، بیوشیمی، جداسازی خون و همچنین برای آزمایش‌های کلینیکی فراهم کنند. میکروفیوژهای هماتوکریت می‌توانند تا 24 لوله مویرگی با ابعاد 1.2*78 میلی‌متر را در خود جای دهند. با توجه به استفاده از لوله‌های میکرو مویرگی برای نگهداری نمونه‌ها در میکرو سانتریفیوژ هماتوکریت، نمونه‌های بسیار کوچکی از خون برای آزمایش نیاز است.