لوله‌های این دستگاه (همچنین به عنوان لوله‌های: اپودورف، لوله‌های میکروفیوژن و لوله‌های میکروکنترلزای) نامیده می‌شوند. لوله‌های با مقاومت بالا از شیشه یا پلاستیک ساخته شده‌اند تا دقیقا در حفره‌های روتور قرار بگیرند.
لوله‌های این دستگاه (همچنین به عنوان لوله‌های: اپودورف، لوله‌های میکروفیوژن و لوله‌های میکروکنترلزای) نامیده می‌شوند. لوله‌های با مقاومت بالا از شیشه یا پلاستیک ساخته شده‌اند تا دقیقا در حفره‌های روتور قرار بگیرند. آنها ممکن است در ظرفیت از ۵۰ میلی لیتر تا ظرفیت‌های بسیار کوچکتر استفاده شده در میکروکنترلرها که به طور گسترده در آزمایشگاههای زیست شناسی مولکولی استفاده می‌شوند، متفاوت باشند. Microcentrifuges معمولا به لوله‌های میکرو سانتریفیوژ پلاستیکی یکبار مصرف با ظرفیت ۲۵۰ تا ۲٫۰ میلی لیتر می‌رسند.
لوله شیشه‌ای می‌تواند با اکثر حلالها مورد استفاده قرار گیرد، اما گرایش بیشتری دارد. آنها می‌توانند مانند سایر ظروف آزمایشگاهی پاک شوند و می‌توانند با اتوکلاو شدن استرلیزه شوند. خراشهای کوچک از دست دادن بی‌دقتی می‌تواند موجب شکستن در نیروهای قوی تحمیل شده در طول اجرا شود. لوله‌های شیشه‌ای به داخل آستین‌های لاستیکی نرم افزوده می‌شود تا آنها را در طول اجرا بپوشند.
لوله پلاستیکی، گران‌تر است و با توجه به آن می‌تواند به همان اندازه شیشه‌ای با دوام باشد. هنگامی که لوله‌های سانتریفیوژ پلاستیکی استفاده می‌شود، آب ترجیح داده می‌شود. آنها به طور کامل تمیز، و معمولا ارزان قیمت و به اندازه کافی برای یک بار مصرف در نظر گرفته می‌شود. “میکرولیتر لوله” پلاستیکی یکبار مصرف ۰٫۵ تا ۲ میلی لیتر معمولا در میکرو مرکز فورج استفاده می‌شود.
آنها از یک پلاستیک شفاف انعطاف پذیر شبیه به پلی اتیلن ساخته شده‌اند.
به شکل نیمی از مخروطی و با کلاههای انعطاف پذیر، چسبانده شده‌اند.
برای نمونه‌های بزرگتر از بطریها، که ظرفیت آنها از ۲۵۰ تا ۱۰۰۰ میلی‌لیتر استفاده می‌شود. اگر چه بعضی از شیشه‌های سنگین ساخته شده‌اند، بطریهای سانتریفیوژ معمولا از پلاستیک‌هایی از قبیل پلی پروپیلن یا پلی کربنات ساخته می‌شوند