کارکردن یک سانتریفیوژ نامتعادل ممکن است باعث آسیب قابل توجهی شود و به اپراتور و سایر پرسنل آزمایشگاه آسیب برساند. جرم کل هر لوله باید تا حد امکان نزدیک باشد. این موضوع در سرعت‌های بسیار بالا اهمیت بیشتری پیدا می‌کند.
از محکم بودن سطح اطمینان حاصل کنید.
همیشه قبل از شروع کار از قرار گرفتن این دستگاه روی سطح مناسب اطمینان حاصل کنید.
سانتریفیوژ را متعادل یا بالانس کنید.
کارکردن یک سانتریفیوژ نامتعادل ممکن است باعث آسیب قابل توجهی شود و به اپراتور و سایر پرسنل آزمایشگاه آسیب برساند. جرم کل هر لوله باید تا حد امکان نزدیک باشد – این موضوع در سرعت‌های بسیار بالا اهمیت بیشتری پیدا می‌کند. متعادل کردن جرم‌ها با دقت 0.1 گرم توصیه می‌شود، و مهم است که لوله‌ها را بر اساس جرم و نه حجم متعادل کنید. به عنوان مثال، یک نمونه متشکل از مایع با چگالی بیشتر یا کمتر از آب با حجم مساوی را متعادل نکنید.
در حالی که روتور در حال حرکت است، درب را باز نکنید.
بسیاری از سانتریفیوژها دارای «safety shutoff» هستند. با این حال، این قابلیت فقط برق روتور را متوقف می‌کند. پس از فعال شدن این قابلیت، روتور همچنان به دلیل اینرسی خود برای مدتی می‌چرخد تا زمانی که در اثر اصطکاک متوقف شود.
اگر سانتریفیوژ می لرزد یا تکان می‌خورد، دوشاخه را بکشید.
کمی لرزش طبیعی است، اما مقادیر بیش از حد آن می‌تواند به معنای خطر باشد. ابتدا بررسی کنید که لوله‌ها به درستی متعادل شده باشند. اگر با این کار مشکل حل نشد، با سانتریفیوژ تا زمانی که توسط سازنده یا فروشنده بررسی نشده است، کار نکنید